生物病毒是如何在生物学上分类的？ 信托避税分类有哪些类型的

前言：大家想知道任何病毒的分类学、任何类群的命名学，都可以在评论区敲出来哦~

不大成熟/传统/常用的分类：

按宿主：动物病毒，植物病毒，噬菌体，噬病毒体，真菌病毒。按基因组核酸类型：DNA病毒，RNA病毒。按感染/起病部位，如呼吸道病毒、肠道病毒等。

生物安全等级BSL/ABSL：参见《人间传染的病原微生物名录》。

巴尔的摩(Baltimore)分类系统：

第I类：dsDNA病毒，如疱疹病毒，人乳头瘤病毒。第II类：ssDNA病毒，无论正链还是负链。例如：细小病毒科。很多此类下的病毒复制时，含有正链基因组和负链基因组的两种病毒粒子都可以产生，两种病毒粒子都能正常复制，所以一般不对正负链ssDNA做细分。含正负链基因组病毒粒子数量比例有的是1:1（如B19病毒，依赖病毒属），也有极化的比例，如小鼠微小病毒+/- = 1/99。第III类：dsRNA病毒，如呼肠孤病毒科。第IV类：(+)-ssRNA病毒，如肠道病毒属（例：脊髓灰质炎病毒）。第V类：(-)-ssRNA病毒，如正/副黏病毒科，弹状病毒科（例：狂犬病毒），丝状病毒科（例：埃博拉病毒）等。第VI类：ssRNA反转录病毒，参见核糖病毒域 - 副RNA病毒界 - 酶录转逆病毒门 - 逆转录酶病毒纲 - 录转逆病毒目，如HIV。第VII类：dsDNA反转录病毒，参见核糖病毒域 - 副RNA病毒界 - 酶录转逆病毒门 - 逆转录酶病毒纲 - 布朗伯格病毒目，如乙肝病毒。

显见巴尔的摩分类系统是基于遗传物质类型、复制方式、关键酶的类型等及其近乎严格的对应关系。

ICTV分类系统：

ICTV就是国际病毒分类委员会(International Committee of Taxonomy of Viruses)，所以他们在干的事情恰好与这个问题对口。

该系统含有域(realm)、界(kingdom)、门(phylum)、纲(class)、目(order)、科(family)、属(genera)、种(species)，以及七个“亚X”（sub-X, 亚域直至亚属），一共15级分类阶元。ICTV在2023年全面推行该系统，并且每年更新。下面的答案中提到了一个ICTV 1999年分类标准，然而今天的ICTV分类与1999年已是云泥之别。分类阶元体系的分类依据主要来自遗传学/基因组学/分子结构/演化关系，而遗传物质类型（DNA/RNA，正义还是反义，单链还是双链，环状还是线性等，以及数目）、复制方式、宿主类型等紧紧围绕之，但并不严格对应。所以你会惊奇地发现嗜肝DNA病毒被划进核糖病毒域(Riboviria)，人乳头瘤病毒(HPV)是环状dsDNA病毒却被划入单DNA病毒域(Monodnaviria)。不要认为域的划分对应核酸类型。

如你对某个分类单元为何这样分类感兴趣，可到ICTV搭建的病毒分类浏览器Current ICTV Taxonomy Release查询和下载查看有关的文件。或者评论区问我。

病毒系统学发展得很快。下面这6个域中有两个域——核酶病毒域(Ribozyviria)和A-DNA病毒域(Adnaviria)是最近一次才新增的，在我最初撰写本答案时（2023年8月）还尚未出现。

总的来说，当前ICTV分类系统包含6域、10界、17门、39纲、65目、233科、2606属（比2023年几乎增加了一倍）和10434种，与旧版分类阶元系统的不同可参见Walker PJ, Siddell SG, Lefkowitz EJ, et al. Recent changes to virus taxonomy ratified by the International Committee on Taxonomy of Viruses (2023). Arch Virol. 2023 Aug 23.。很多已发现病毒尚未归类，暂时悬置于分类系统之外。这仅仅是已知的病毒，实际存在的病毒要比这多得多。此外病毒的分类现在也存在许多争议。

域：A-DNA病毒域(Adnaviria)、双DNA病毒域(Duplodnaviria)、单DNA病毒域(Monodnaviria)、核糖病毒域(Riboviria)、多DNA病毒域(Varidnaviria)、核酶病毒域(Ribozyviria)。

A-DNA病毒域(Adnaviria)：dsDNA病毒，噬古菌体，纤维状病毒(filamentous viruses, FVs)。感染真核生物的FVs均属ssRNA病毒（丝状病毒科），感染真细菌的FVs均属ssDNA病毒（丝杆病毒科），感染古菌的纤维状病毒分属于4个科（见下），已知与其他两个类群大不相同，原本一直以来未能确定上级分类。该域最大特征即是其主要衣壳蛋白(major capsid protein, MCP)二聚体与它们的基因组dsDNA互作时可催化其由寻常的B型转换为A型，所以病毒粒子内的基因组都是A-DNA的形式。最后决定新建一域来安置之。

> 齐利格病毒界(Zilligvirae)，名称来自沃尔夫勒姆·齐利格(1925-2005)，一位极端嗜热古菌噬菌体研究先驱。

杆状病毒门(Taleaviricota) - 线状病毒纲(Tokiviricetes)，两个目：(1)、原初病毒目(Primavirales) - 三层病毒科(Tristromaviridae)，2属：α-三层病毒属 - 火棒菌属纤维状病毒(Pyrobaculum filamentous virus, PFV1, 2)，β-三层病毒属 - 多孔热变形菌病毒(Thermoproteus tenax virus, TTV1)；(2)、细带病毒目(Ligamenvirales)，3科：脂毛病毒科(Lipothrixviridae)（3属10种，感染硫化叶菌目(Sulfolobales)）、竿形病毒科(Rudiviridae)（7属17种）、爪状病毒科(Ungualviridae) - 爪状病毒属(Captovirus)（该原先为脂毛病毒科下一个（γ-~）属）。其中竿形病毒科无囊膜。脂毛病毒科末端带有像细菌鞭毛一样的结构，爪状病毒的该结构形状如同爪子（下图），再配上它细长的病毒粒子就更像一个爪子了，故名。爪状病毒的爪爪

双DNA病毒域(Duplodnaviria)：分类依据是其主要衣壳蛋白(MCP)的结构中包含HK97折叠(the HK97 fold (HK97-MCP))。词源学：前缀“duplo”来自拉丁语“dūplō”即“双”。下属唯一的界：

> 香港病毒界(Heunggongvirae)：“Heunggong”来自广东话的“香港”。HK97的“HK”指的即是“Hong Kong”，也是大肠杆菌HK97噬菌体的名称来源。下分 衣壳病毒门 和 尾噬菌体门，依据是它们分别感染真核生物与原核生物。

衣壳病毒门(Peploviricota) - 疱疹病毒纲(Herviviricetes) - 疱疹病毒目(Herpesvirales)（3科23属130种）。3科分别是鱼疱疹病毒科(Alloherpesviridae)、贝类疱疹病毒科(Malacoherpesviridae)和疱疹病毒科(Herpesviridae)。疱疹病毒大家应该都不陌生，单纯疱疹病毒(HSV)-1, 2、水痘-带状疱疹病毒(VZV)、爱泼斯坦-巴尔病毒(EBV)、巨细胞病毒(MCV)、猪伪狂、马立克、鸡传喉、鸭瘟、牛传鼻都在这个类群。真可谓是“毒才辈出”。此外，其中的许多致瘤病毒，是原癌基因的研究者最早关注的东西。尾噬菌体门(Uroviricota) - 有尾噬菌体纲(Caudoviricetes)，其中包含不少古菌噬菌体。该纲共含47科1197属3601种，下分4个目：(1)、crAss噬菌体目(Crassvirales)（4科42属），“crAss”是一款分析软件的名字；(2)、Kirjokansi病毒目(Kirjokansivirales)（4科7属），“Kirjokansi”意为芬兰语“彩色封面”(kirjo + kansi)，是芬兰史诗《卡勒瓦拉》/《英雄国》(Kalevala)中能给拥有者带来财富和幸福的奇物；(3)、甲烷杆噬菌体目(Methanobavirales)，2科：厌氧消化器病毒科(Anaerodiviridae)（名称来源没有查到，疑来自anaerobic digesters，故名，待进一步深扒）、莱辛格病毒科(Leisingerviridae）；(4)、Thumleima病毒目(Thumleimavirales)（4科8属），“Thumleima”是梅泰(Meitei)神话中的盐女神。